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數碼金相顯微鏡的使用說明如下：
（1）在使用油浸式鏡頭之前，抬起舞臺，用一根光滑干凈的棍子蘸一滴杉木油，然后將其滴在物鏡的前鏡頭上。此時，避免棒接觸鏡頭，不要滴太多油，否則鏡頭會損壞或弄臟。
（2）當使用低倍物鏡進行觀察和聚焦時，注意避免透鏡和樣品之間的碰撞。你可以從側面看鏡頭，盡可能向下移動鏡臺，直到鏡頭幾乎接觸到樣品（但不能接觸），然后從目鏡觀察。此時，應使用粗調手輪來調整對象圖像，直到它第一次被看到，然后應使用微調手輪調整對象圖像直到它非常清晰。
（3）原則上，每個物鏡都應在觀察前安裝好。在安裝或拆卸物鏡時，必須升高載物臺以避免接觸透鏡。如果選擇了一定的放大倍數，則可以參考總放大倍數表來選擇目鏡和物鏡。
（4）當樣品放置在裝載平臺上時，應在裝載平臺中重置觀察表面。如果是小樣本，可以用彈簧壓縮板壓縮。
（5）將光源插頭連接到電源變壓器，然后將變壓器連接到室內220V電源。出廠前已對照明系統進行了校準。
（6）每次更換燈泡時，必須反復調整燈座。燈泡插入燈座后，將過濾玻璃放置在孔徑燈條上，然后旋轉燈座并前后調節，使光源均勻明亮地照射在過濾玻璃上。這樣，燈泡已正確調整。此時，將燈座的偏心環旋轉一定角度，將燈座固定在底盤中。燈座和偏心環上有紅點。如果它們被移除，紅點應該是相反的。
（7）為了匹配具有不同數值孔徑的物鏡，設置了可調孔徑光棒和視場光棒，以獲得良好的物體圖像和顯微攝影對比度。
